Пещера расположена в точке, где от села Топольного достигнет 4 километра, а также находится на высоте 50 километров по течению реки Ануй над селом Солонешным.
Её вход - просторный портал, открывающийся буквально в нескольких метрах от дороги и прорывающий горный склон. Он поражает своей шириной и внушительностью.
Пещера представляет собой уникальный природно-археологический памятник, способный восхищать исследователей и туристов.
Археологи ведут раскопки здесь с 1982 года; на сегодняшний день обнаружено более 20 культурных слоев, раскрывающих поэтапную историю от палеолита до средневековья. Открытые предметы теперь выставлены в музеях Сибири и Алтайского края.
Этот природный шедевр возник около 800 000 лет назад, когда потоки воды вымывали породу, создавая полость с внутренними тупиковыми галереями. Пещера открыла три внешних отверстия, которые со временем превратились в центральные и верхние входы, а также правую полость. Верхнее отверстие пропускало солнечный свет в просторную часть грота, одновременно служа великолепным дымоходом. В результате пещера стала идеальным убежищем для животных и людей, дарованным самой природой.
Происхождение названия раскрывается рядом версий.
Согласно одной из них, в конце XVIII века в пещере жил старообрядец-монах Дионисий. В те годы местные поселения почитали древние обряды, а он пользовался уважением и авторитетом.
Коренные жители называют её Аю-Таш - «медвежья гора» или «медвежий камень». Легенда гласит о шамане, практикующем черную магию, который навлекал алтайцев на бесконечный дождь. Люди обратились к белому шаману за помощью; тот избавил их от потока и превратил дожди в камень, который теперь покоится в недрах Денисовой пещеры.
Пещера известна с давних времен как среди туристов, так и спелеологов. Упоминания о Денисовой появляются в публикациях XIX века, например, Н.К. Рерих после визита к ней в 1926 г., когда он участвовал в экспедиции по алтайским землям. Искусствовед Шапоников заметил сходство одной из картин Рериха с реальным пейзажем портала и его окрестностями. Пещеру открыли как археологический памятник в 1977 г., когда сотрудники Института археологии и этнографии СО РАН, включая палеонтолога Оводова, провели раскопки.
Сквозь толщу отложений скрываются древнейшие следы истории Северной Азии, уходящие на многие метры глубже. Это место стало отправной точкой для миграций в Японию, Корею, Китай, Дальний Восток и даже Северную Америку, подтверждая это обширный археологический материал. Количество находок Денисовой уже превышает 80 000 предметов: от орудий труда до украшений, оружия, более сотни видов животных и флористических остатков.
Пещеру обитали почти 300 000 лет назад; первыми посетителями стали неандертальцы. Археологи строго придерживаются кодекса поведения внутри пещеры. Существует легенда о духе Белой Дамы - дочери Ксении, которая, как считается, скрывается в боковых галереях и за завалами.
В 1990 г. был создан международный туристический комплекс «Денисовая пещера», ставший одним из первых научно-ориентированных центров алтайского туризма. Сотрудники комплекса предлагают разнообразные экскурсионные программы для всех желающих открыть тайны этой величественной пещеры.